В настройках ЕГАИС надо привязать транспортный модуль к базе. При этом настройки расположения базы в списке баз 1С должны полностью совпадать на всех ПК, вплоть до нижнего/верхнего регистра.
У нас, к примеру, на одном клиенте был указан именной адрес сервера большими буквами, на другом маленькими, на третьем - IP вместо имени, пришлось от этого избавляться.